Makoto, Chiaki ve Kousuke, aynı sınıfta okuyan üç yakın arkadaştır. Sürekli beraber takılmakta ve zamanlarını çoğunlukla beyzbol oynayarak geçirmektedirler. Günün birinde Makoto, kimya laboratuvarında üstüne düştüğü garip nesne sayesinde hayal edemeyeceği bir güce sahip olur; zamanda sıçrama...

Yeni keşfettiği gücü sayesinde canı ne isterse yapmaya başlayan Makoto, gücünü kullanıp geçmişini değiştirerek geleceğe yön vermeye çalışır. Ancak Makoto, zamanla oynamanın sandığından daha tehlikeli ve zamanın kimse için beklemediğini fark edecektir.

Tsutsui Yasutaka'nın "The Little Girl Who Conquered Time" adlı romanından uyarlanan Toki o Kakeru Shôjo (The Girl Who Leapt Through Time) - Zamanda Sıçrayan Kız, toplam 12 ödül kazandı.