El Topo, küçük oğlu ile birlikte at sırtında çöllerde gezen bir silahşördür. Bir yolculuk esnasında bölgede yaşayan tehlikeli silahşörlerle karşılan El Topo hepsini öldürür ancak oğlunu rehin bırakıp bölgeyi terk etmek zorunda kalır. Artık kendi gücüyle yüzleşmesinin zamanıdır.

İki bölümde irdelenen film, birinci bölümde klasik western tarzında ilerlerken, ikinci bölümde ise yeniden doğuş ve insanın kendi içerisinde yaptığı yolculuğa odaklanıyor. Alejandro Jodorowsky’nin sürrealist bir bakış açısıyla ele aldığı bu eser, mutlaka izlenmesi gereker metaforlarla dolu bir film.