Sayaka Kudo, oldukça problemli bir genç kızdır. Lise 2. sınıf öğrencisi olmasına rağmen, akademik açıdan ortaokul 4. sınıf düzeyindedir. Sürekli okul değiştirmekte, hiç arkadaş edinememekte ve gittiği yerlerde sorun çıkarmaktadır. Üniversite giriş sınavına hazırlanması için annesi onu Seiho Cram Okulu'na gönderir. Okul yöneticisi Yoshitaka Tsuboya, Sayaka'nın akademik problemlerinden haberdardır ve Sayaka'nın istediği üniversite olan, Japonya'da kazanmanın en zor olduğu Keio Üniversitesi'ne kabul edilmesine yardımcı olmayı kişisel bir mesele haline getirir. Babası Sayaka'ya hiç inanmamaktadır. Sayaka ise hem okul hem de yaz tatili boyunca sürekli çalışarak babasına yanıldığını göstermeye çalışacaktır.

Birigyaru - Flying Colors, bir öğrencinin azmi ve bir öğretmenin, öğrencisinin gerçek yeteneğini ortaya çıkarmasının yaşanmış bir olaya dayanan öyküsünü beyaz perdeye getiriyor.