Hayatta kalmaya çalışan insanoğlu, tüm insanlığın geleceği için birer birer Matrix'e karşı gelmeye başlar. Başkaldıranların sayısı arttıkça makineler, dünyada son kalan gerçek şehir kabul edilen insanlığın direniş merkezi olan Zion'a saldıracaktır. Matrix sisteminin tam anlamıyla durdurulup durdurulamayacağı, gerçek dünya ile sanal dünya Matrix'in arasında sıkışıp kalan Neo'nun kendini kurtarabilmesine bağlıdır.

Bilim-kurgu sinemasında devrim yaratan The Matrix serisinin son filmi olan The Matrix Revolutions, makineler ve insanoğlu arasındaki amansız savaşı beyazperdeye aktarıyor.